La caracterización de variedades de almendro (Prunus amígdalus Batsch) se realiza tradicionalmente mediante las descripciones pomológicas y más recientemente se han introducido las caracterizaciones bioquímicas, particularmente las basadas en el polimorfismo isoenzimático. El objetivo del presente trabajo fue la caracterización de 11 variedades de almendro mediante el polimorfismo isoenzimático de peroxidasas, catecol, oxidasas y esterasas. Se muestrearon tallos en período de reposo y se conservaron a < 20 ºC hasta el momento del procesado. La separación electroforética se realizó en gel de acrilamida al 10%. Las isoenzimas estudiadas presentaron diferente grado de polimorfismo. Las peroxidasas permitieron caracterizar los cultivares Ferragnes, Peerless y AI; las catecol oxidasas Tuono y Emilito y las esterasas Ferragnes, Marcona, Ruby y Ferraduel quedando los demás cultivares reagrupados en diferentes modelos.