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Identificación de alelos con efecto significativo en la diferenciación de poblaciones


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Autores: D. García, C. Carleos, J.A. Baro, J. Cañón
Volumen: 96A-3 (277-281)
Tipo de Artículo: Producción Animal
Palabras Clave: Marcadores, asignación racial, significación
Resumen:

Los sistemas de clasificación racial basados en frecuencias de los alelos de marcadores y genotipos individuales se emplean en programas de conservación, detección de fraudes, análisis de poblaciones híbridas, estudios forenses y pruebas de paternidad. La técnica ‑asignación de individuos a una raza maximizando la probabilidad de que el individuo pertenezca a ella‑ es simple, aunque su aplicación rigurosa supone cierta complejidad. Este trabajo revisa uno de los aspectos críticos: la presencia de alelos atípicos. Éstos se definen como los que tienen frecuencias extremas en alguna raza; casos particulares son los alelos específicos de raza y los alelos ausentes en una raza. El enfoque que se ha seguido consistió en examinar para cada locus el comportamiento de una tabla de contingencia con las razas frente al número de alelos. La significación de cada tabla y de cada celda de cada tabla se estimó mediante tres métodos distintos: el habitual, basado en el estadístico Chi-cuadrado, y dos aproximaciones por simulación de contrastes exactos: MC y MCMC. En los casos simulados, la significación de la tabla de contingencia se estima como la proporción de simulaciones en que la probabilidad de la tabla observada es superior a la de la simulada. Se estudia la posibilidad de emplear un enfoque análogo para determinar una significación por celda.

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BASES DE DATOS Y REPOSITORIOS

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