Se examinan los presupuestos de las escuelas frecuentista y bayesiana para la inferencia científica. Se discute la aproximación bayesiana cuando hay información a priori, cuando se admite que la hay bajo ciertas hipótesis, cuando la información a priori es vaga y cuando no hay información previa al experimento. Los métodos más usuales en mejora genética animal (Índices de selección, BLUP, Máxima verosimilitud, REML) son presentados bajo el punto de vista de las dos escuelas y se examinan sus propiedades en uno y otro caso. Se expone también la predicción bayesiana del valor genético y de los parámetros genéticos. Finalmente se discuten las aproximaciones frecuentista y bayesiana desde un punto de vista ontológico y práctico, y se exponen casos en los que la inferencia bayesiana da soluciones que aún no ofrece la escuela frecuentista.