El carácter difuso de la contaminación agraria de regadío dificulta su cuantificación y asignación a un determinado territorio. Los objetivos de este trabajo son unificar criterios metodológicos para la evaluación agroambiental y proponer índices que cuantifiquen la contaminación inducida desde el regadío. Para ello, se ha desarrollado una herramienta informática denominada EMR (Evaluador Medioambiental de Regadíos) que evalúa la calidad del riego e impacto agroambiental en base a balances de agua, sales y nitrato en cuencas hidrológicas de regadío. El comportamiento de los índices propuestos es analizado a partir de datos registrados en varios regadíos de la cuenca del Ebro. Los Índices de Contaminación por Sales (ICS) y Nitrato (ICN) están basados en la masa unitaria de contaminantes exportada corregida por condicionantes "naturales y socioeconómicos" de los regadíos. ICS e ICN se relacionan con el aprovechamiento del agua y del nitrógeno aportado en la fertilización, factores claves para minimizar la contaminación. ICS e ICN admiten una mayor masa de contaminantes exportados en los regadíos con mayor salinidad natural y necesidades de fertilización, lo que no impide que exijan por igual la adecuada gestión de todos los regadíos. EMR se constituye como una herramienta de fácil manejo al servicio de la vigilancia agroambiental del regadío.