Este trabajo pretende evaluar el efecto de la selección contra la susceptibilidad al scrapie en la variabilidad genética de la raza ovina Xalda de Asturias mediante el uso de información genealógica y molecular. El Libro Genealógico de la raza Xalda incluía 1851 animales (1444 vivos). Se muestrearon 304 animales y se genotiparon con 14 microsatélites. La variabilidad genética se evaluó mediante la heterocigosis esperada (He; obtenida a partir de información molecular) y gene diversity (GD; obtenida a partir de información genealógica). Se identificaron los animales nacidos en la última estación de partos y seleccionados para reproductores. Las pérdidas de variabilidad genética se calcularon incluyendo o no el genotipo de scrapie como un criterio añadido a la selección. La inclusión del genotipo de scrapie como criterio de selección produce pérdidas añadidas de más de un 2% para He en las hembras. En cuanto a los machos, la situación es más crítica debido al pequeño número de carneros disponibles de genotipo ARR/ARR. Se discuten las consecuencias para el manejo de la raza Xalda.