El Chequeo Médico de la PAC ha introducido una serie de medidas de apoyo a diferentes sectores agrarios al objeto de minimizar los efectos de la aplicación de un pago desacoplado en los sectores menos competitivos de la agricultura. Este trabajo analiza la puesta en marcha del plan de apoyo a la agricultura de secano a través del Plan Nacional de Fomento de Rotaciones, analizando sus efectos sobre la sostenibilidad de estos sistemas agrarios. La aplicación empírica se ha centrado en el secano de Castilla y León. Los resultados de las simulaciones llevadas a cabo en las diferentes comarcas seleccionadas como caso de estudio a través de la Programación Matemática Positiva ponen de manifiesto la influencia que tiene en la acogida al Plan la orientación productiva hacía los cultivos objeto de éste. El análisis de los resultados permite concluir además sobre la necesidad de simplificar los mecanismos de puesta en marcha de esta ayuda pues la eficiencia de la ayuda es en muchos casos limitada.