Se realizaron aislamientos de Trichoderma spp. y Bacillus spp. con potencial antagonista para el control de Phytomatotrichopsis omnivora, patógeno del suelo que causa pudrición de raíz en varias especies vegetales conocida como ?pudrición texana?. Los objetivos de este trabajo fueron seleccionar e identificar a nivel de especie, cepas de Trichoderma spp. y Bacillus spp. recolectadas en el noroeste de México, que permitan tener un eficiente control de Phymatotrichopsis omnivora. Se seleccionaron tres aislados de Trichoderma por su capacidad antagónica y comportamiento in vitro contra P. omnivora. La identificación molecular de los aislados obtenidos (TB = aislado de bugambilia, TM = aislado de mango y TF = aislado de ficus) y de la cepa control (TN = aislado de nogal), arrojaron los siguientes resultados: las cepas TB y TM correspondieron a la especie asperellum y las cepas TF y TN a la especie virens. Las tres cepas evaluadas mostraron un alto potencial antagónico al compararse con la cepa control (TN) y serán consideradas en posteriores evaluaciones en invernadero. Todas las cepas mostraron las Clases 1 y 2 de antagonismo contra el patógeno (valores de 1,0 a 1,5), según la escala Baker & Cook. Adicionalmente, se obtuvieron 32 aislados de Bacillus spp., de los cuales cuatro fueron seleccionados por su mayor halo de inhibición contra Phymatotrichopsis omnivora (B6 = aislado de jatropha; B14 = aislado de mango; B18 = aislado de maíz; B21 = aislado de maíz). Los resultados de la identificación molecular a los aislados nos indicaron que las cepas B6, B14 y B18 pertenecen a la especie cereus sensu lato, mientras que la cepa B21 a la especie subtillis. Estos resultados contribuyen al control biológico de Phymatotrichopsis omnivora que afecta gran diversidad de plantas cultivadas.